在分子生物学及医学研究领域,福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本被视为重要的生物资源,它们承载着大量的历史样本和临床信息。然而,由于在固定和储存过程中,DNA面临降解、交联和片段化等问题,FFPE样本成为二代测序(NGS)分析的一大技术瓶颈。因此,如何从FFPE样本中提取到合格的DNA以建立文库,已成为现阶段测序研究领域亟待解决的关键问题。
什么是FFPE样本
FFPE样本指的是采用福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded)技术处理和保存的生物组织样本。这一方法能够长期有效地保存组织标本,便于运输,因此在病理学、组织学和分子生物学研究中广泛应用,尤其是在癌症和遗传学研究中,FFPE样本成为研究历史样本和临床样本的重要来源。
FFPE样本的应用
FFPE样本通过福尔马林固定技术,能够有效保存组织结构和细胞形态,石蜡包埋则进一步稳定化这些样本,为长期保存创造了条件。这些样本具有极高的存档价值和临床应用潜力,能够跨越数年的保存时间,并且非常适合进行回顾性研究。总的来说,FFPE样本在连接临床病理数据与分子水平研究方面发挥着重要作用,特别适用于从大量历史临床样本中提取基因组信息的研究项目。
FFPE样本的特点
FFPE组织切片被誉为生物医学研究中的“瑰宝”,它们蕴藏着丰富的疾病信息,为临床诊断和科学研究提供重要支持。然而,FFPE标本的制作过程既带来了诸多优势,也伴随一定的挑战。
高质量文库的关键在于修复
从FFPE样本中提取临床材料是一种常见且有效的方法。然而,固定和保存过程可能会损害样本中的核酸质量,影响其完整性。为了获得高质量的序列数据,尤其在样本总量有限的情况下,这一过程变得尤为挑战。尊龙凯时推出的FFPE修复试剂(HieffNGS® FFPE DNA Repair Reagent,Cat#12606ES),由多种酶按照特定配比优化混合而成,经过验证,能够有效修复FFPE样本中的DNA。这款修复试剂不仅能够提高文库产量,还具有良好的无偏嗜性,显著提升了文库的成功率。
在文库构建过程中进行的实验显示,添加修复试剂的组别相比未添加修复试剂的组别,低质量FFPE样本的文库产出显著提高,而高质量FFPE样本的文库产量提升不明显。此外,对修复试剂在不同温度下的稳定性进行测试,结果表明,在4℃和25℃下放置四周,文库产量基本没有明显下降。
FFPE样本承载着大量珍贵的临床和科研数据,通过尊龙凯时的FFPE样本修复试剂,研究人员能够最大限度地挖掘这些样本的潜能,将“沉睡”的数据转化为推动医学进步的重要资源。无论是肿瘤基因组研究、遗传学分析,还是历史样本解读,尊龙凯时的FFPE修复试剂都将为您的研究提供强有力的支持。
产品选择指南
产品名称:MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit
产品编号:V218375ES
产品应用:磁珠法石蜡包埋组织DNA提取试剂盒(瓶装)
产品名称:HieffNGS® FFPE DNA Repair Reagent
产品编号:12606ES
产品应用:FFPE DNA样本修复试剂
产品名称:HieffNGS® DNA Library Prep Kit 20
产品编号:2012927ES
产品应用:全能型DNA建库试剂盒
产品名称:HieffNGS® One Pot Pro DNA Library Prep Kit V3
产品编号:V312194ES
产品应用:一步法DNA建库试剂盒