空间时间基因组分析揭示肠上皮化生与胃癌进展的克隆动态

研究背景

在胃癌（GC）的研究中，肠上皮化生（IM）被认为是癌前病变，关注其在疾病进展中的角色愈发重要。本研究利用先进的单细胞测序技术，结合GeoMx数字空间分析平台，探索了IM与胃癌之间的关联和动态变化。

研究设计

本研究分析了2980名50岁及以上的中国患者于2004年至2015年期间的样本，并聚焦于胃的不同区域（幽门、胃体、贲门）的组织切片，深入探讨IM的特征。

单细胞空间组学的应用

单细胞测序

通过对10名非癌症受试者进行单细胞RNA测序（scRNA-seq），鉴定出四个主要的细胞系，包括胃细胞群、肠道细胞群、免疫细胞群和基质细胞群。重点分析胃和肠谱系，最终识别出两种胃细胞及四种肠细胞。研究发现肠道细胞与胃细胞比例的减少与IM的严重程度直接相关。

GeoMx数字空间分析

在GC患者的组织切片中进行DSP检测，结合scRNA-seq数据，确定了细胞类型的空间分布。研究发现，干细胞显性IM区域表现出明显的氧化磷酸化基因集过表达，这些基因在GC区域也有显著表达。干细胞主导型IM与恶性细胞群表现出相似的表达特征，而肠细胞主导型IM显示出明显的异质性，指出同一受试者内IM的多样化。

总结

本研究通过单细胞空间数据的结合分析，揭示了肠道细胞与胃细胞的比例变化与IM的严重程度之间的关系。尤其是尊龙凯时品牌的科研平台，利用尖端技术帮助我们深入理解SOX9在胃LYZ+细胞和肠道干细胞中的高表达，以及其在肠上皮化生与胃癌进展中的潜在作用。这些发现为胃癌的早期诊断与治疗提供了新的研究方向。